Los protagonistas son una pareja de simpáticos peces payaso (Clownfish), padre e hijo. El padre Marlin y su hijo Nemo llevan una vida estable y "feliz" y pacífica en la Gran Barrera de Coral frente a la costa de Australia. El padre del pez, Marlin, siempre ha sido cauteloso y tímido en sus acciones. Aunque es padre, eso no le impide convertirse en un conocido cobarde. Es precisamente por esto que su hijo Nemo a menudo se pelea con Marlin, e incluso desprecia un poco a su padre. Hasta que un día, Nemo, que siempre había anhelado aventuras en el océano, salió nadando del arrecife de coral donde vivían. Justo cuando Nemo quería estirar su colita, un barco pesquero capturó sin piedad al feliz Nemo y lo vendió a una clínica dental en la Bahía de Sydney, Australia.
En el fondo de la Gran Barrera de Coral, la noticia de que la vida o la muerte de su amado hijo era repentinamente incierta fue como un rayo caído del cielo para el padre pez Marin. Aunque era tímido y tenía miedo de meterse en problemas, Marin no tuvo más remedio que arriesgar su vida para salvar a su amado hijo. Está decidido a seguir el ritmo de la corriente oceánica australiana y emprender un largo viaje para encontrar a su hijo.
Aunque haya tomado una decisión, esto no significa que Marin pueda abandonar su carácter cobarde de la noche a la mañana. Varias persecuciones emocionantes con el gran tiburón blanco Bruce en el camino pronto le hicieron querer darse por vencido, casi frustrando la esperanza de un reencuentro entre padre e hijo. Pero afortunadamente, Marin conoció a Dory, una Regal Blue Tang de Samaritan. Dori es un pez grande, le entusiasma ayudar a los demás y tiene una mente amplia. Aunque la amnesia severa a menudo dejaba estupefacto a Marin, la compañía de Dori gradualmente le hizo comprender cómo usar el coraje y el amor para superar su miedo interior, y también comprendió que algunas cosas en la vida realmente valen la pena. El principio de correr riesgos y trabajar duro por su cuenta. .
De esta manera, las aventuras de los dos peces en el vasto Océano Pacífico les hicieron hacer todo tipo de amigos y encontrarse con todo tipo de crisis. Y el padre pez Marín finalmente superó todas las dificultades, se reunió con su hijo y regresó sano y salvo a su ciudad natal. En el pasado, el cobarde Marin, que incluso menospreciaba a su propio hijo, ¡se convirtió en un verdadero héroe a los ojos de su hijo después de esta prueba! Un gran drama de reunión familiar llegó a su fin con los ojos llenos de lágrimas.