SEELE es la organización secreta que existía antes del segundo impacto del parlamento encabezado por el portavoz Gill. Esta organización ocultó la verdad sobre el Segundo Impacto y la existencia de los Apóstoles, y tuvo el privilegio de utilizar la Sociedad de Naciones y otros países. Después del segundo impacto, utilizó la Liga de Naciones como tapadera para establecer el Comité de Compleción Humana, así como las agencias de servicios secretos NERV y EVA.
El plan de finalización humana de SEELE se completa basándose en los registros de los Rollos del Mar Muerto. El objetivo del programa es hacer avanzar a la humanidad a otra etapa de evolución. Sin embargo, debido a la pérdida de la Lanza Longinus y la traición de Ikari Gendo (el comandante del cuartel general de NERV), la etapa final del plan debía ser revisada.
Por cierto, SEELE significa alma en alemán. Todas las organizaciones relacionadas con SEELE, como GEHIRN y NERV, también tienen sus nombres en alemán.
El Servicio Secreto NERV
Un servicio secreto que implementa el plan de finalización humana y no está restringido por la ley. El método de su formación es disolver la organización de investigación original GEHRIN y dejar que su equipo original se traslade a la nueva organización. La sede está ubicada en Neo-Tokyo 3. Se trata de una organización internacional con sucursales en Alemania y Estados Unidos. Aunque desde la perspectiva de los forasteros, la Sociedad de Naciones era su órgano directo, en realidad no tenía ninguna influencia sobre él. NERV está directamente bajo el mando de SEELE. Aunque posee varios Evangelions (armas humanoides decisivas de uso general), NERV solo posee la fuerza para luchar contra los apóstoles. Cuando fue atacada por la Brigada Zhanji, no tenía la fuerza para defenderse.
Como se mencionó anteriormente, NERV y SEELE están subordinados. El jefe de NERV es Yuando Ikari, y el líder de SEELE es el Portavoz. Gill Ikari Yuando también es miembro del Consejo SEELE. Su asiento es el 13, lo que también simboliza al gran traidor.