A partir de la primera parte, Uchiha Sasuke, Haruno Sakura y Uzumaki Naruto (Kyuubi fue sellado en su cuerpo por su padre, el Cuarto Hokage) son la séptima clase (maestro: Kakashi), posteriormente Orochimaru ( uno de los tres ninjas) atacó Konoha y mató al tercer Hokage. Después de eso, apareció Uchiha Itachi (hermano de Sasuke y miembro de Akatsuki). Sasuke no sabía la verdad y pensó que Itachi había acabado con el clan, por lo que quería venganza. Más tarde, Tsunade (uno de los tres ninjas) se convirtió en Hokage. Sasuke descubrió que su fuerza era muy inferior a la de Itachi, por lo que se refugió con Orochimaru. En el camino para unirse a él, tuvo una batalla decisiva y trascendental con Naruto en el Valle del Fin, y apenas ganó. Naruto descubrió que no podía traer de vuelta a Sasuke y entrenó con Jiraiya (uno de los tres ninjas). La primera parte terminó apresuradamente así. La segunda parte (Shippuden) tiene lugar 5 años después de la primera parte. Todos han crecido, y Akatsuki (la organización para capturar a las bestias con cola, el fundador: Payne, el cerebro detrás de escena: Uchiha Madara) también se ha convertido. activo. Después de que Naruto regresó a Konoha después del entrenamiento, se enteró de que Gaara Kazekage (con una cola en su cuerpo) fue capturado por los miembros de Akatsuki Deidara y Red Sand Scorpion, y fue a Sand Ninja Village. Gaara resucitó más tarde (no específico). Más tarde, Sai (un miembro de las raíces Anbu de Konoha) se unió al Equipo 7, Kakashi se estaba recuperando de su enfermedad (Sharingan excesivo) y Yamato lo reemplazó. Conocieron al Sasuke adulto que era demasiado fuerte. Todos perdieron y Sasuke se fue. Akudos e Hidan (ambos miembros de Akatsuki) capturaron las dos colas y mataron a Asuma en Konoha. Naruto los mató a todos con su nueva técnica Rasenshuriken. Sasuke mató a Orochimaru y encontró a Suigetsu, Xiangling y Jugo como socios para encontrar a Itachi. Sasuke luchó contra Deidara en el camino, Deidara se hizo estallar y Sasuke logró escapar. Pain y Jiraiya tuvieron una feroz batalla, y Jiraiya murió en la batalla. Sasuke mató a Itachi (Itachi estaba seriamente distraído). Madara le contó a Sasuke el motivo por el cual el clan Uchiha fue exterminado (no más detalles, puedes verlo por ti mismo). Sasuke y otros se unieron a Akatsuki y capturaron con éxito al Ocho Colas con el nuevo Mangekyō Sharingan, pero en realidad capturaron al doble del Ocho Colas. Naruto aprendió senjutsu y tuvo una feroz batalla con Pain en Konoha (esta parte fue particularmente emocionante, con cuatro generaciones apareciendo, recordó Nagato. Al final, Nagato (el que controlaba Pain de los Seis Caminos con el Ojo de Samsara) cambió su forma). maneras, sacrificó su vida y resucitó a muchas personas (excepto Jiraiya). ¡La Conferencia de las Cinco Sombras está a punto de tener lugar! La Conferencia de las Cinco Sombras se llevó a cabo en el país neutral de Iron Country. Durante la reunión, Danzo intentó usar Sharingan para controlar la reunión y elegirse a sí mismo como líder de las fuerzas aliadas. El guardaespaldas de Mizukage, Ao (Ao tiene un ojo blanco), descubrió que resultó que el ojo derecho y el brazo derecho de Danzo debajo del vendaje fueron trasplantados de Uchiha Shisui. En ese momento, Bai Zeze apareció en el lugar de la reunión e interrumpió la reunión. Sasuke se estaba preparando para buscar venganza de Danzang fuera de la reunión. Danzo aprovechó la oportunidad para escapar, Sasuke confió en Susano'o y el otro Kage para luchar duro y fue derrotado y Madara llegó a tiempo para salvar a Sasuke. Madara comenzó a contar la historia del Sabio Rokudo, quien una vez fue el Jinchuuriki de Diez Colas. Antes de su muerte, usó la Estrella Explosiva de la Tierra para atrapar la entidad de Diez Colas en la luna y dividió el chakra de Diez Colas en nueve. partes para convertirse en las Bestias de Nueve Colas. Madara reveló el propósito de recolectar bestias con cola: convertirse en el Jinchuuriki de Diez Colas e implementar el Tsukuyomi Infinito que hipnotiza al mundo entero. Luego se pidió a las cinco principales naciones ninja que entregaran el Ocho Colas y el Nueve Colas. Después de ser rechazados, se declaró la Cuarta Guerra Ninja. Madara llevó a Sasuke para alcanzar a Danzo, y Danzo mostró su mano derecha (N Sharingan en su mano) y activó la técnica prohibida de Sharingan: Izanagi, pero aún así fue derrotado. Sasuke perdió la vista debido al uso excesivo del Sharingan, por lo que Madara trasplantó los ojos de Itachi a Sasuke. Al mismo tiempo, el Ocho Colas VS Kisame, el Raikage llegó cuando la pelea era inextricable, y los dos hermanos mataron a Kisame (en realidad, Kisame no estaba muerto, estaba escondido en el músculo de la gran espada de Shark y fue llevado de regreso a Raiyin). Village by the Eight-Tails para realizar la misión de infiltración). Kabuto trasplantó las células de Orochimaru y se volvió aún más BT que Orochimaru. Se acercó a Madara y le pidió cooperación. Usó la Reencarnación de la Tierra para convocar a Nagato, Scorpion, Itachi, Kakuzu, Deidara y el último ataúd misterioso que aceptó cooperar. Naruto llegó a la isla donde practicaba el Ocho Colas (acompañado por Yamato, Kai y otro Jonin Yamashiro Aoba) y siguió al Ocho Colas para aprender a controlar las bestias con cola. En la práctica, es necesario extraer el Chakra de las Nueve Colas. Cuando Naruto es erosionado por la conciencia de las Nueve Colas, la madre de Naruto, Kushina, aparece en la conciencia de Naruto (de la misma manera que apareció la cuarta generación), y Naruto está en ella. La conciencia de su madre. Con la ayuda de su padre, separó con éxito la conciencia y el chakra de Nueve Colas y reveló el cuerpo inmortal. Luego, Kushina comenzó a decir la verdad sobre el ataque al Kyuubi hace 16 años.
Anko resultó herido y la persona del clan Aburame que fue capturada por el equipo de reconocimiento murió. El resto eran Scorpion y los demás y las tropas de Kankuro que llegaron encontraron a su hermano y le dijeron a Sai algo conmocionado que si le hacía algo. lastima a sus compañeros, Nunca perdones ~ El equipo de asalto de Kankuro pelea con Scorpion y los demás. . En la primera ronda, los miembros de cada aldea ninja cooperaron brillantemente y el equipo de asalto de Kankuro ganó. El alma de Escorpión pudo trascender bajo la persuasión de Kankuro. Después de confiarle las marionetas de sus padres a Kankuro, el efecto de la reencarnación de la tierra sucia desapareció. Naruto aprendió movimientos especiales de Kirabi, quien descubrió que el Rasengan usado por Naruto era muy similar al Cañón de la Bestia con Cola que estaba a punto de enseñarle a Naruto.