El 19 de enero de 1946, con la autorización de los Aliados, el Comandante Supremo de las Fuerzas Aliadas en Japón MacArthur promulgó el "Aviso Especial" y el "Estatuto del Tribunal Militar Internacional para el Lejano Oriente", anunciar el establecimiento formal del Tribunal Militar Internacional para el Lejano Oriente en Tokio. Enjuiciar a los criminales de guerra japoneses.
El 29 de abril de 1946, el Tribunal Militar Internacional para el Lejano Oriente procesó formalmente a 28 criminales de guerra de Clase A, entre ellos Tojo Hideki. El 3 de mayo, el tribunal celebró su primera reunión pública y comenzó a juzgar los crímenes de Tojo Hideki y otros criminales de guerra. Del 3 al 4, el fiscal jefe leyó un auto de procesamiento de 42 páginas, en el que se enumeraban los crímenes contra la paz, los crímenes de guerra y los crímenes contra la humanidad cometidos por los acusados desde el 1 de enero de 1928 hasta el 2 de septiembre de 1945.
El Juicio de Tokio comenzó el 3 de mayo de 1946 y finalizó el 12 de noviembre de 1948. Duró más de dos años. Hubo 818 sesiones judiciales, 419 testigos comparecieron ante el tribunal para declarar y 4336 piezas de juicio. Se aceptaron pruebas. Hay 48.412 páginas de registros de juicios en inglés. El veredicto de 1.231 páginas se leyó a partir del 4 de noviembre de 1948 y no se completó hasta el día 12.
El Tribunal Militar Internacional para el Lejano Oriente finalmente condenó a 7 criminales de guerra de Clase A, incluido Hideki Tojo, a muerte en la horca, a 16 criminales de guerra de Clase A, incluido Koichi Kido, a cadena perpetua y a 2 criminales de guerra de Clase A. los delincuentes a 20 años y 7 años de prisión respectivamente. De los otros tres criminales de guerra de Clase A, a uno se le suspendió el juicio debido a una enfermedad mental y a los otros dos se les eximió del procesamiento porque murieron durante el juicio. En la madrugada del 23 de diciembre de 1948, siete criminales de guerra, incluido Hideki Tojo, fueron colgados en el potro de la muerte en la prisión de Sugamo en Tokio.