Tema musical 6?1 "DAYS", cantante: FLOW, letra: KEIGO HAYASHI, KOHSHI ASAKAWA, compositor: TAKESHI ASAKAWA, arreglista: FLOWamp; Shōnen Heart", Vocalista: HOME MADE Family, Letrista/Compositor: KURO/MICRO/U-ICHI, Compositor/Arreglista: Takahiro Watanabe (episodios 14-26) 6?1 "太の真ん中へ(Taiyō no Mannaka e)", Cantante: Bivattchee (ビバッチェ), Letrista/Compositor: Tsutsumi Shinichi, Arreglista: ビバッチェ?9?9 Ogura Kenji (episodios 27-32, 34-39) 6?1 "sakura", Cantante: NIRGILIS (ニルギリス), Letrista: Aya Iwata, Compositor: Nori Kurihara/Ana Iwata/Takaki Ito, Arreglista: Nirvana (episodios 40-49)
Tema final 6?1 "Himitsu Kichi (Secret Base)", Cantante: Takada Saoe, Letrista/ Compositor: Takada Saoe, arreglista: TOMI YO (episodios 1-13, 26) 6?1 "Fly Away", cantante: Izawa Mami, letrista/compositor: Izawa Mami, arreglista: Jun Abe (episodios 14-25) 6?1 "Tip Taps Tip", Cantante: HALCALI, Letrista: U, Compositor/Arreglista: Tanaka Yusuku (episodios 27-39) 6?1 "Canvas", Cantante: COOLON, Letrista/Compositor: COOLON, Arreglista: MIne-Chang (episodios 40-49)
Interludio 6?1 "STORYWRITER", por SUPERCAR 6?1 "trance arruinado", por NEWDEAL 6?1 "draft any funk", por NEWDEAL 6?1 "GET IT BY YOUR HANDS", de Watanabe Hiroshi a.k.a. Quadra 6?1 "Niji", de Denki Groove (episodio 50) 6?1Time-lines, de Hiroyukl Kasal
Tema musical de la versión del juego 6?1 "Realize", de FLOW (Eureka Seven TR1: Nueva Ola, Eureka Seven: Nueva Visión)