La historia describe la repentina aparición de monstruos llamados colectivamente "dragones" en la tierra. A partir de entonces, el mundo cambió. Finalmente, nació entre humanos una niña con poderes sobrenaturales llamada "D". poder de los dragones. Un día, Monobe Yu, el único "D" masculino del mundo, llegó a Midgar, la academia donde se reunían los "D" de todo el mundo, con una orden de transferencia. Allí, fue testigo del cuerpo desnudo de la chica de cabello plateado Elise Freya, y se reunió con su hermana Monobe Fukatsuki, de quien se había separado hace tres años, y comenzó una nueva vida estudiantil.