Es el año 2035 d.C. Desde que el mundo fue invadido por un virus mortal en 1996, el prisionero James Cole se vio obligado a servir como voluntario y viajar en el tiempo de 2035 a 1996 para rastrear la causa de la propagación del virus ese año, para que los científicos puedan encontrar formas. para prevenir y evitar que suceda. Sin embargo, hubo un error en el viaje en el tiempo y Cole fue enviado a Baltimore en 1990. La psiquiatra Catherine Shirley le diagnosticó esquizofrenia y delirios porque le describió a la gente que 5 mil millones de personas morirían a causa de un desastre viral en 6 años. En el manicomio, se llevaba particularmente bien con su compañero paciente Jeffrey Goins. Goins tomó la iniciativa de ayudarlo a escapar del manicomio, pero Cole fue reclutado por científicos en 2035 cuando lo encerraron en una habitación oscura. No hubo problema con el segundo viaje en el tiempo, pero Cole descubrió que el origen del virus estaba en Filadelfia. Entonces encontró a Catherine y le pidió que lo ayudara a ir a Filadelfia a encontrar al culpable que liberó el virus: el Ejército de los Doce Monos. Tienen este extraño patrón de doce monos en un círculo como símbolo. Debido a la profecía de Cole al niño en el granero, Catherine creyó que Cole no era de esta época. Catherine creyó en sus palabras y estaba decidida a ayudarlo a salvar el destino de la humanidad. El "Ejército de los Doce Monos" resultó ser la "Asociación del Movimiento de Liberación Animal", y su organizador fue el amigo de Cole, Jeffrey, hace seis años. El padre de Jeffrey es el famoso experto en virus Colander. Jeffrey es un loco que lucha por la libertad de los animales. Secuestró a su padre y organizó el Ejército de los Doce Monos, pero Colander iba a matar a todos los animales que el médico había encarcelado. el zoológico fueron liberados. Ese virus mortal no tiene nada que ver con los Doce Monos. Cole decidió no preocuparse por el futuro. Justo cuando él y Catherine esperaban una vida mejor en el aeropuerto, inesperadamente descubrieron que el asistente del médico Peters era el verdadero culpable de que la policía lo matara. (Cuando Cole era un niño, también estuvo presente para presenciar este incidente. Esto explica que los sueños de Cole en realidad son ver la historia de amor entre su yo futuro y el psiquiatra)
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