Will Bynum nació y creció en el barrio de 41st Street y Woods en el lado sur de Chicago. A la edad de 6 años ya había ingresado a los jardines del street ball en Chicago. Se ganó el apodo de "Thriller" después de hacerse un nombre con actuaciones explosivas en competencias locales y nacionales en West's Clany High School.
Después de graduarse de la escuela secundaria, Klein fue a la Universidad de Arizona. El entrenador Olson no le dio mucho crédito: tenían a Jason Gardner, un ex guardia All-American del segundo equipo. Se transfirió a Georgia Tech durante su segundo año. Cuando era junior, anotó una bandeja para derrotar a la Universidad Estatal de Oklahoma en la Final Four de la NCAA, lo que llevó a los Hornets a las Finales de la NCAA de 2004. En la final, Bynum anotó 17 puntos, el máximo del equipo, pero no logró sacudir a UConn liderado por Okafor y Ben Gordon.
Después de cuatro años de universidad, Bynum decidió participar en el draft.