¿Quién arrojó la granada al extremo oscuro del tren expreso? ¿Y qué quiere decir Belmode cuando dice en el minuto 17:43 de la animación que mi compañero destruyó la conexión de antemano?

La conexión fue destruida de antemano, probablemente la conexión entre vagones de tren.

Creo que Subaru Okiya es el candidato más probable para ser Shuichi Akai. Quien lanzó la granada fue Shuichi. En este caso, a Bermod le resultó imposible disfrazarse, y Subaru Okiya, que apareció después, tenía ojos muy similares a los de Shuichi.