Observadas bajo un microscopio de campo oscuro, las espiroquetas flotan en los tejidos y tienen tres modos de movimiento característicos:
① De tipo rotativo, que se basa en su propio eje largo para girar y moverse hacia adelante y hacia atrás esta es la forma principal de invadir el cuerpo humano;
② La distancia entre las espirales telescópicas se mueve, alargando constantemente el cuerpo, uniendo un extremo y luego reduciendo el paso para avanzar; >
③ Estilo serpiente. Doblarse, como una serpiente arrastrándose, es un patrón común, y este movimiento característico se puede distinguir de otras espiroquetas en la vulva.
Treponema pallidum no se puede distinguir morfológicamente de la espiroqueta Pian y la espiroqueta Pinta.
El Treponema pallidum debe distinguirse de otras especies treponémicas que se encuentran en la vulva. Principalmente con Borrelia refingens y Borrelia Balanitidis.
Los puntos clave para la identificación son que los dos tipos de espiroquetas tienen una forma gruesa, menos espirales gruesas y son menos activos que los treponemas pálidos.
Aunque Borrelia gracilis tiene hélices más delgadas y densas, la distancia entre las hélices no es tan densa como la de Treponema pallidum, y no existe un patrón de movimiento típico de Treponema pallidum. También existen varias espiroquetas en la mucosa oral normal, entre las cuales la más común es el Treponema Microdenticum alrededor de las encías, que es similar al Treponema pallidum y puede confundirse fácilmente. Bajo un microscopio electrónico, Treponema pallidum aparece en forma de una pequeña serpiente con diferentes grosores y colores desiguales. Hay dos haces de filamentos (Flamenta) en ambos extremos que envuelven el cuerpo bacteriano. Cada haz está compuesto por tres haces de fibrillas separados (Fibrillas), que se encuentran en el citoplasma en ambos extremos del cuerpo bacteriano. Cuando el cuerpo espiral se contrae, se forma un movimiento espiral. En el pasado se pensaba que este filamento era "Flagelos", pero ahora se ha confirmado que se trata de un artefacto provocado por la rotura de haces de fibrillas. Hay una membrana alrededor del cuerpo de Treponema pallidum y hay un citoplasma (Peripiast) o una estructura en forma de saco (CapsulaStractula) y un quiste de espiroqueta (Treponelcyst) en el cuerpo. Se observa fácilmente en cepas cultivadas y también en cepas virulentas, pero su significado aún no está claro.