El Aeropuerto Internacional Guglielmo Marconi está situado en Bolonia y fue renovado y ampliado en 2004. Es el décimo aeropuerto más transitado de Italia, con un tráfico de pasajeros que superó los 4 millones en 2007, y es un bastión para las rutas internacionales. Además, debido a la posición estratégica de Bolonia, la Estación Central de Bolonia se considera el centro ferroviario más importante del norte de Italia.
Bolonia cuenta con un sólido sistema de servicio público de autobuses, gestionado por la Empresa de Transporte Público Azienda Bolonia (ATC).